ההומאופת המטפל מנחה בנוגע להגבלות מיוחדות בזמן הטיפול.
בין הדברים שכדאי להימנע משימוש בהם בזמן הטיפול נמצאים קפאין, קמפור, מנטה, שמנים אתריים וסמים.
מלבד זאת אין בדרך כלל צורך בדיאטות או הגבלות מיוחדות.
במהלך טיפול הומאופתי יש להימנע משימוש בתכשירים טבעיים כגון רסקיו רמדי ופרחי באך, גם אם הומלצו על ידי רוקח בבית מרקחת.
אין להוריד תרופות ללא פיקוח רופא!